データdata1とdata2 について「２標本の平均の差が 0 であるか否か」の二標本 t 検定を行う場合は関数t.test()を用います。等分散を仮定しないという場合(Welch の検定を行う場合)は、var.equal=F とします。

> data2<-c(12,15,23,19,29,28,13,17,16,21)
> data1
[1] 20 25 34 25 26 28 29 15 18 19
> data2
[1] 12 15 23 19 29 28 13 17 16 21
> t.test(data1,data2,var.equal=T)
Two Sample t-test

data: data1 and data2
t = 1.754, df = 18, p-value = 0.09644
alternative hypothesis: true difference in means is not equal to 0
95 percent confidence interval:
-0.9097768 10.1097768
sample estimates:
mean of x mean of y
23.9 19.3