| 代数 | 当主・藩主 | 備考 |
| 1 | 酒井忠稠 | 若狭小浜藩主・酒井忠直の子. 越前国敦賀藩主[1682-1706] |
| 2 | 酒井忠菊 | 越前国敦賀藩主[1706-1722] |
| 3 | 酒井忠武 | 越前国敦賀藩主[1722-1731] |
| 4 | 酒井忠香 | 越前国敦賀藩主[1731-1788] |
| 5 | 酒井忠言 | 越前国敦賀藩主[1788-1797] |
| 6 | 酒井忠藎 | 越前国敦賀藩主[1797-1833] |
| 7 | 酒井忠毗 | 越前国敦賀藩主[1833-1867] |
| 8 | 酒井忠経 | 越前国敦賀藩主[1867-1871]→廃藩置県 |
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