| 藩名 | 藩主家[石高] | 城・陣屋 | 藩庁所在地 |
| 彦根藩 | 井伊家[30万石] | 彦根城 | 滋賀県彦根市金亀町 |
| 大津藩 | 分部家[2.1万石] | 大溝陣屋 | 滋賀県高島市勝野 |
| 膳所藩 | 戸田家[3万石]→本多家[3万石]→菅沼家[3.11万石]→石川家[7万石]→本多家[6万石] | 膳所城 | 滋賀県大津市本丸町 |
| 仁正寺藩 | 市橋家[1.7万石] | 西大路陣屋 | 滋賀県蒲生郡日野町 |
| 三上藩 | 遠藤家[1万石] | 三上陣屋 | 滋賀県野洲市三上 |
| 水口藩 | 加藤家[2万石]→鳥居家[2万石]→加藤家[2.5万石] | 水口城 | 滋賀県甲賀市水口町水口 |
| 宮川藩 | 堀田家[1.3万石] | 宮川陣屋 | 滋賀県長浜市宮司町 |
| 山上藩 | 安藤家[6万石]→<天領>→稲垣家[1.3万石] | 山上陣屋 | 滋賀県東近江市山上町 |
