藩祖京極高通は近江朽木氏の朽木宣綱の次男。京極高知の養子となり徳川秀忠の小姓を仕める。宮津藩主京極高知より1万石を分知。ここに、合わせて1万3000石の丹後国峯山藩京極家が誕生する。