『相模風土記』には1224(元仁元)年に鎌倉で疫病が発生し祈願祭が鎌倉の各地で行われたとある。この山ノ内の八雲神社もかつては牛頭天王社と称していたことから、この辺りに起源があるのだろう。
室町時代には関東管領上杉憲房が厚く信仰していたとされ、上杉氏が京都から勧請したという言い伝えも残る。