この門は歴史が古い。
ここから多摩川を越えた所には後北条氏の居城として知られる滝山城がある。堂宇は、滝山城築城の際に、城の鬼門除けとして移築された。そもそもは、天暦６(952)年の創建という。
　その後、荒廃したというが、滝山城を支配した北条氏照の臣下の石川土佐守が眼病平癒の御礼として堂宇を再建するに至った。そして、「大日八坊」といわれる一山八ヵ寺として名を広める。

　また、典型的な天台宗一規一画を留めた寺としても有名だった。
　滝山城は南の八王子城に移ったため廃城となり、後北条氏も豊臣氏により滅亡する。しかし、大日堂は天正19(1591)年には徳川家より朱印地を下賜され、その地位を保った。
　なお、大日堂はかつては、この仁王門のすぐ北の現在の園地にあったが、享保17(1732)年に丘の上に移された。